El herbario de la universidad de los Llanos, se inicia con el apoyo al proyecto presentado al Instituto Colombiano para la educación ICFES, que en el año de 1987 desembolso la suma de un millón ochocientos mil pesos, representados en parte de la infraestructura actual.

Posteriormente, 17 de diciembre de 1990, el Consejo superior mediante el acuerdo 106 de 1990 lo crea e institucionaliza, con el fin de garantizar su reconocimiento por parte de organismos nacionales e internacionales que realizan y apoyan la investigación botánica. Hacia el año de 1997, la Missouri Botánica Garden hizo aportes para la adecuación de las instalaciones y bibliografía.

Con el fin de dar cumplimiento a la ley 99, el artículo 12 del acuerdo 309 y el artículo primero de la resolución 1115 de 2000, emanada del ministerio del medio ambiente, la colección se registró ante el instituto Alexander Von Humboldt con el acrónimo LLANOS y le correspondió el Numero 017.